More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7380 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  73.85 
 
 		 440 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  100 
 
 		 439 aa  864    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  66.59 
 
 		 437 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  66.82 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  39.3 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  37.1 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  36.71 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  36.62 
 
 		 435 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  35.52 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  33.15 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.98 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  35.31 
 
 		 450 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  34.65 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  34.65 
 
 		 449 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.65 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  34.65 
 
 		 449 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.65 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  34.65 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  37.01 
 
 		 825 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  32.23 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  34.64 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  34.45 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.83 
 
 		 832 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  32.11 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.55 
 
 		 845 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  35.31 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.59 
 
 		 806 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  32.5 
 
 		 753 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 830 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 1235 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  32.44 
 
 		 422 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 874 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.02 
 
 		 840 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 860 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.44 
 
 		 1144 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 842 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 859 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.59 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 505 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  29.85 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  38.31 
 
 		 794 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  35.64 
 
 		 862 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 		 427 aa  136  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 685 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  29 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 843 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  31.66 
 
 		 752 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 849 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 785 aa  134  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 636 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 636 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  33.21 
 
 		 732 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 843 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  31.03 
 
 		 891 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 844 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 1105 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 637 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 867 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1107 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.01 
 
 		 847 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 847 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 795 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>