143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7339 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60.64 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  59.14 
 
 		 95 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  62.22 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  59.14 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.51 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  55.91 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  56.7 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  53.76 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  53.61 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  61.18 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  53.76 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  57.61 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  59.09 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  52.75 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  53.76 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  59.09 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  52.87 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  51.65 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  51.09 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  52.08 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  56.67 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  52.13 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  56.82 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  56.04 
 
 		 96 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  56.99 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  54.44 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  50.54 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  50 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  50 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.33 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  51.14 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  47.31 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.16 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.33 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  50.6 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  45.74 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  45.65 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 114 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  49.4 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  47.13 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  42 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  43.43 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 		 95 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.48 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.16 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  43.33 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.59 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  44.19 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  44.09 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  44.83 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  41.76 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  46.97 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  43.9 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  43.02 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  40.66 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  42.11 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  32.22 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  41.54 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  42.42 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  36.47 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  43.28 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  35.53 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.36 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.88 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.91 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  37.18 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.91 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  33.73 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  34.44 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.88 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.37 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3649  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.03 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>