More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7337 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  100 
 
 
175 aa  353  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  79.43 
 
 
175 aa  294  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  78.29 
 
 
187 aa  292  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  71.1 
 
 
175 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  69.94 
 
 
175 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  69.36 
 
 
175 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  69.36 
 
 
175 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  67.44 
 
 
171 aa  235  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  63.95 
 
 
171 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  63.95 
 
 
171 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  64.57 
 
 
172 aa  230  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  63.95 
 
 
171 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  58.51 
 
 
188 aa  216  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  60.92 
 
 
175 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  60.82 
 
 
171 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  60.8 
 
 
187 aa  215  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  61.4 
 
 
171 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  60.8 
 
 
187 aa  215  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  60.92 
 
 
174 aa  214  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  60.82 
 
 
177 aa  213  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  63.16 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  60.45 
 
 
193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  61.14 
 
 
173 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  61.14 
 
 
173 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  58.14 
 
 
177 aa  201  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  59.75 
 
 
173 aa  197  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  56.4 
 
 
168 aa  193  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  56.5 
 
 
180 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  55.56 
 
 
174 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  54.6 
 
 
168 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  54.6 
 
 
168 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  55.75 
 
 
168 aa  191  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  57.31 
 
 
168 aa  190  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  56.55 
 
 
187 aa  190  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  54.02 
 
 
168 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  56.73 
 
 
168 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  57.67 
 
 
176 aa  187  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  51.72 
 
 
168 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  51.74 
 
 
168 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  52.54 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  51.15 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  51.15 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  51.72 
 
 
173 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  53.11 
 
 
173 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  53.49 
 
 
167 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  52.41 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  51.81 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  51.81 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  53.45 
 
 
177 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  53.14 
 
 
169 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  51.46 
 
 
184 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  53.37 
 
 
174 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  51.43 
 
 
172 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  55.36 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  50.88 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50.87 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  55.36 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  55.95 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  49.71 
 
 
176 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  55.36 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  54.76 
 
 
167 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  55.36 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  55.36 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  55.36 
 
 
167 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  55.36 
 
 
167 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  55.36 
 
 
216 aa  170  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  55.36 
 
 
179 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  55.36 
 
 
167 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  55.36 
 
 
179 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  52.12 
 
 
174 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  54.17 
 
 
167 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  52.94 
 
 
167 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  53.57 
 
 
167 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  53.57 
 
 
167 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  52.73 
 
 
188 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  52.98 
 
 
169 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  50 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  50 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  51.18 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  46.78 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  50.6 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  51.19 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  50.88 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  51.18 
 
 
167 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  47.16 
 
 
171 aa  160  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  47.95 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  50.6 
 
 
173 aa  160  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  52.38 
 
 
169 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  50.3 
 
 
179 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  51.46 
 
 
177 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  47.43 
 
 
171 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  48.84 
 
 
167 aa  157  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  50.6 
 
 
169 aa  157  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  49.15 
 
 
170 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  50.6 
 
 
172 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  50.6 
 
 
172 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  51.19 
 
 
169 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  46.29 
 
 
169 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  48.21 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  51.19 
 
 
169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>