87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7243 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1119    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  79.13 
 
 
572 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  40.44 
 
 
620 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  40.78 
 
 
523 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  36.96 
 
 
523 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  57.3 
 
 
399 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  57.3 
 
 
399 aa  194  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  55.68 
 
 
399 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  56.76 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  52.25 
 
 
762 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  53.93 
 
 
892 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  55.06 
 
 
420 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  39.52 
 
 
737 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  52.6 
 
 
888 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  34.18 
 
 
693 aa  171  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  39.39 
 
 
1562 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.05 
 
 
400 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  49.44 
 
 
888 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  33.4 
 
 
692 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  50.54 
 
 
405 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  50.54 
 
 
405 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  50.54 
 
 
405 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  45.83 
 
 
405 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  49.46 
 
 
405 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  52.3 
 
 
522 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  51.15 
 
 
516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  38.02 
 
 
735 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  49.13 
 
 
886 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  43.35 
 
 
630 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  50.87 
 
 
746 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  49.13 
 
 
886 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  40.48 
 
 
375 aa  150  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  46.24 
 
 
753 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  45.93 
 
 
432 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  41.74 
 
 
393 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  42.51 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  56.15 
 
 
514 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  62.38 
 
 
537 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  41.9 
 
 
272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  60.4 
 
 
536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  42.35 
 
 
272 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.18 
 
 
272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  57.84 
 
 
272 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  40 
 
 
272 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  56.31 
 
 
272 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  40.86 
 
 
275 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  37.25 
 
 
300 aa  97.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.84 
 
 
289 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  47.71 
 
 
275 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  29.52 
 
 
590 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.72 
 
 
547 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.35 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  26.89 
 
 
320 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  31.95 
 
 
273 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  26.76 
 
 
320 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  26.27 
 
 
320 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  24.42 
 
 
320 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  31.25 
 
 
272 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  25 
 
 
320 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.82 
 
 
273 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  27.51 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  35.44 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  27.64 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.65 
 
 
260 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  36.94 
 
 
289 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  25.49 
 
 
302 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  38.89 
 
 
380 aa  50.4  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.58 
 
 
274 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  27.88 
 
 
592 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.55 
 
 
282 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  32.63 
 
 
302 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.87 
 
 
303 aa  48.5  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  34.07 
 
 
395 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  25 
 
 
301 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.91 
 
 
277 aa  47.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.5 
 
 
311 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  25.59 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  23 
 
 
302 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  36.11 
 
 
389 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  26.29 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  24.51 
 
 
301 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  35.06 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 
585 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  26.97 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  24.88 
 
 
303 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  26.32 
 
 
275 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  24.79 
 
 
292 aa  43.5  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>