More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7179 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  894    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.21 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  55.1 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  57.82 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  55.53 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  50.45 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.28 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  41.86 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.15 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  46.5 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  43.86 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  39.9 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  38.91 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  43.21 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  41.61 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  45.09 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.92 
 
 		 454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  37.58 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  37.58 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.81 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.58 
 
 		 435 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 468 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  42.51 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  42.79 
 
 		 432 aa  289  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.14 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  41.98 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  43.58 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.54 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.76 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  42.07 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.19 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.5 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.55 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  41.69 
 
 		 436 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.12 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.08 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.27 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  35.27 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.27 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.91 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  35.85 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.59 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.85 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  31.16 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  28.71 
 
 		 431 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.23 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.88 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.82 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  34.33 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  35.2 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  33.82 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  33.82 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  33.82 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.09 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.84 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  33.6 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  32.35 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  31.3 
 
 		 481 aa  76.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  32.76 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.42 
 
 		 761 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  31.88 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.33 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  24.68 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  28.16 
 
 		 574 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  37.37 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.8 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  30.6 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  33.98 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.39 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.17 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.7 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.14 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.95 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.07 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  33.71 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  27.22 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.29 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  34.96 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>