More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7175 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  100 
 
 		 410 aa  840    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  67.82 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  66.26 
 
 		 409 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  65.09 
 
 		 407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  65.09 
 
 		 407 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  65.52 
 
 		 433 aa  554  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  64.76 
 
 		 411 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  62.59 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  63.08 
 
 		 409 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  63.02 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  62.77 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  61.56 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  62.77 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  62.65 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  62.16 
 
 		 413 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  60.34 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  70.86 
 
 		 181 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  54.74 
 
 		 236 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  48.05 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  48.21 
 
 		 236 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  48.25 
 
 		 232 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  47.19 
 
 		 230 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  47.19 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  47.19 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  47.19 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  51.95 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  48.92 
 
 		 230 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  50.65 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  46.93 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  46.75 
 
 		 230 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  48.72 
 
 		 231 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  43.17 
 
 		 232 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  57.58 
 
 		 193 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  48.46 
 
 		 248 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  54.22 
 
 		 178 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  53.01 
 
 		 179 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  47.78 
 
 		 235 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  44.55 
 
 		 250 aa  189  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  41.56 
 
 		 236 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  44.27 
 
 		 233 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  41.51 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  39.38 
 
 		 232 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  39.22 
 
 		 232 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.89 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  37.79 
 
 		 232 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 234 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  39.32 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 222 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  40.17 
 
 		 240 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  39.57 
 
 		 223 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 		 229 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  35.45 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 234 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  38.94 
 
 		 223 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  35.71 
 
 		 251 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  37.27 
 
 		 232 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  40.36 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  36.25 
 
 		 229 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.12 
 
 		 229 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  36.44 
 
 		 248 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.82 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 229 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 229 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.51 
 
 		 221 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.38 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.47 
 
 		 227 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 		 230 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.48 
 
 		 248 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  36.96 
 
 		 220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.63 
 
 		 246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  36.75 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 245 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 		 244 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 251 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 		 235 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  32.58 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  32.9 
 
 		 229 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  32.2 
 
 		 295 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  32.2 
 
 		 295 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  33.33 
 
 		 254 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  37.18 
 
 		 227 aa  99.8  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  29.95 
 
 		 244 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.93 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 		 296 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 		 227 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  30.23 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  34.68 
 
 		 223 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 		 230 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>