More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7091 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7091  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.2 
 
 
253 aa  343  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.580386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.14 
 
 
254 aa  314  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.18 
 
 
254 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0912  3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase  59.68 
 
 
254 aa  297  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.57 
 
 
252 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  59.29 
 
 
254 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.767039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
252 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal  0.320851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 
261 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
252 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
252 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.87 
 
 
259 aa  291  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0482872  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
254 aa  291  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136015  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2204  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.38 
 
 
252 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
252 aa  289  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00360013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
252 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
253 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0762  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  57.87 
 
 
252 aa  287  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.750513  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
261 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361004  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2489  putative short-chain dehydrogenase  59.06 
 
 
252 aa  284  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
255 aa  284  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0605669  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.43 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.153171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162049  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.851813  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
255 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.799292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000114329  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
256 aa  280  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
252 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0454791  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
279 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19949  normal  0.151219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.81 
 
 
255 aa  278  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2534  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II oxidoreductase protein  57.87 
 
 
252 aa  277  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  277  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7121  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (short-chain)  61.42 
 
 
252 aa  277  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0967  hypothetical protein  55.95 
 
 
247 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0937  hypothetical protein  55.95 
 
 
247 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
255 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00832519  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
255 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.64 
 
 
255 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
259 aa  275  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.870695  hitchhiker  0.0000000000642548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2682  putative short-chain dehydrogenase  56.25 
 
 
255 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31510  putative short-chain dehydrogenase  56.25 
 
 
255 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.089471  hitchhiker  0.000038143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 
255 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.215235  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 
252 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1684  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 
252 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.59 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0151424  hitchhiker  0.0000559523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6651  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170863  normal  0.0297726 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
255 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
254 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0244002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
255 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918093  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
255 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  normal  0.0668197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
252 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139382  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3183  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II  63.39 
 
 
253 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
255 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.87 
 
 
252 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327218  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4382  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.64 
 
 
255 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0363369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2869  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.27 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
250 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.99 
 
 
253 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0466593  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 
255 aa  268  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.515865  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.65 
 
 
261 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
250 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
250 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
250 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.56 
 
 
255 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00629853  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6506  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.228171  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.47 
 
 
256 aa  265  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.228275  normal  0.0798454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 
252 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0738  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  57.09 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
260 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.43 
 
 
254 aa  264  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0926  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.69 
 
 
319 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.28 
 
 
267 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
260 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
251 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.718572  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11167  short-chain type dehydrogenase/reductase  57.53 
 
 
250 aa  263  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.81 
 
 
255 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339033  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.81 
 
 
255 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0380  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  56.69 
 
 
252 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1079  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  56.69 
 
 
252 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2515  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  56.69 
 
 
252 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
259 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0024657  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.69 
 
 
252 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.69 
 
 
252 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0923  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.3 
 
 
319 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.732955  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5433  Short-chain alcohol dehydrogenase/3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
260 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206427  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.72 
 
 
252 aa  261  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.367974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.64 
 
 
252 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.75 
 
 
253 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
255 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
260 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2720  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  51.17 
 
 
255 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01666  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.69 
 
 
258 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0141372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>