71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6968 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  74.67 
 
 		 460 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  100 
 
 		 458 aa  902    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  77.85 
 
 		 455 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  78.12 
 
 		 456 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  76.42 
 
 		 458 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  77.46 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  76.21 
 
 		 453 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  38.98 
 
 		 490 aa  299  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  39.86 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  41.69 
 
 		 459 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  36.85 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  37.07 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  37.04 
 
 		 467 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  35.62 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  38.36 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  34.42 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  35.02 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  38.44 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  38.32 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 512 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 539 aa  90.1  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  29.27 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  24.76 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4321  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  19.56 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  26.18 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  33.81 
 
 		 135 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.64 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  22.08 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.09 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 547 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.1 
 
 		 489 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  23.67 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2006  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 529 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.300214  normal  0.433718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.5 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0796  hypothetical membrane associated protein  21.58 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.610272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  23.98 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  24.74 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  25.73 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  30.77 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 899 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 583 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>