More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6960 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  76.56 
 
 		 470 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  100 
 
 		 464 aa  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  74.68 
 
 		 464 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  77.54 
 
 		 451 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  79.82 
 
 		 461 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  75.32 
 
 		 469 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  75.28 
 
 		 481 aa  695    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  54.39 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  47.99 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  47.72 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  49.86 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  47.78 
 
 		 445 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  47.5 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  47.33 
 
 		 404 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  44.77 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.52 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.95 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  48.28 
 
 		 720 aa  339  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  45.72 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  46.26 
 
 		 398 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  45.72 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  44.78 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.65 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.85 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 413 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  49.85 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  44.75 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  47.76 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  46.05 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  45.66 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  44.75 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  44.72 
 
 		 448 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  44.75 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  46.86 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  44.48 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  44.42 
 
 		 405 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  42.3 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  43.49 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  47.04 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  46.43 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.16 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  42.97 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  43.22 
 
 		 514 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  41.85 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  44.81 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  45.07 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  44.12 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  42.98 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  42.35 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.78 
 
 		 466 aa  289  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  44.94 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  40.42 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  40.55 
 
 		 490 aa  285  9e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  40.53 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.63 
 
 		 409 aa  283  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  40.42 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  43.75 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  41.05 
 
 		 405 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  41.05 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  42.41 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  42.05 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  40.7 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 424 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  39.9 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  40.7 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  39.16 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.44 
 
 		 430 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  37.19 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  41.78 
 
 		 411 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.16 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  43.59 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.6 
 
 		 421 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  40.9 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 438 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.96 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  39.7 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  36.12 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.3 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  37.14 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  38.73 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.3 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  36.83 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  41.44 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  40.64 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  37.57 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 406 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.53 
 
 		 433 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.82 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  37.82 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>