53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6915 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  66.67 
 
 		 150 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  69.53 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  66.67 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  55.74 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  54.92 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  45.51 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  48.67 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  42.62 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  36.59 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  33.06 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  28.33 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32.52 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  32.23 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  27.87 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  26.23 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.08 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  28.69 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  27.87 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  28.69 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  26.92 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  23.02 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  30.47 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  30.94 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.23 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  31.03 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  26.61 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  28.07 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.5 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  25.74 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  20.93 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.23 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  28.95 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  22.96 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.34 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  24.65 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  23.26 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  29.73 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  29.11 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  23.77 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  18.8 
 
 		 151 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  25.19 
 
 		 161 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  27.47 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  30.85 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  23.36 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  23.08 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  25.6 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  25.81 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  31.71 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>