16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6894 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6894  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  290  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00106592  normal  0.0638808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0785  hypothetical protein  47.1 
 
 
174 aa  139  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0143  hypothetical protein  48.59 
 
 
158 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.470463  normal  0.546705 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0041  hypothetical protein  50.36 
 
 
174 aa  137  5e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5170  hypothetical protein  45.14 
 
 
152 aa  134  6e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0720  hypothetical protein  46.38 
 
 
152 aa  132  1e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0884  hypothetical protein  49.58 
 
 
152 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611168  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0996  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0212  hypothetical protein  46.34 
 
 
151 aa  125  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3361  hypothetical protein  41.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.837156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3593  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3101  hypothetical protein  41.73 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2361  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  80.1  9e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309866  normal  0.446148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3386  hypothetical protein  37.96 
 
 
315 aa  55.8  2e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.31527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2154  hypothetical protein  37.04 
 
 
291 aa  51.6  4e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2011  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>