More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6789 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  77.99 
 
 
535 aa  840  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  66.92 
 
 
535 aa  725  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
535 aa  1091  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  56.24 
 
 
539 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  56.05 
 
 
539 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  56.03 
 
 
541 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  56.05 
 
 
539 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  55.43 
 
 
553 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  55.47 
 
 
541 aa  583  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
541 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  55.12 
 
 
539 aa  583  1e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
541 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
541 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
541 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
555 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  55.12 
 
 
539 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  54.61 
 
 
557 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  6.09851e-09 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
555 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  55.12 
 
 
539 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  55.08 
 
 
556 aa  575  1e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  54.65 
 
 
539 aa  573  1e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  53.51 
 
 
576 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  52.6 
 
 
544 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  52.79 
 
 
538 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 
562 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  48.79 
 
 
551 aa  516  1e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  48.14 
 
 
547 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  49.44 
 
 
543 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  50.47 
 
 
562 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  50.66 
 
 
562 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  48.21 
 
 
543 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 
532 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 
539 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 
513 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 
526 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 
603 aa  417  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 
571 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 
558 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 
595 aa  400  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 
576 aa  400  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
552 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
552 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.41409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 
562 aa  347  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 
541 aa  345  9e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
560 aa  340  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  37.06 
 
 
572 aa  339  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
537 aa  338  1e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 
522 aa  337  3e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  37.18 
 
 
572 aa  337  4e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  336  6e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64986e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  36.5 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  37 
 
 
572 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  36.06 
 
 
568 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  36.06 
 
 
568 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  36.56 
 
 
571 aa  329  1e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  35.71 
 
 
571 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
555 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
548 aa  317  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
571 aa  313  6e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 
530 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 
548 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
525 aa  306  5e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  35.96 
 
 
598 aa  306  5e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 
561 aa  304  2e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
609 aa  304  2e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
616 aa  304  3e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
554 aa  303  5e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
549 aa  303  7e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  33.58 
 
 
586 aa  301  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 
552 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
567 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  37.88 
 
 
555 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  37.88 
 
 
555 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  3.51198e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
557 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  36.46 
 
 
607 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  36.2 
 
 
549 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
530 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
539 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
539 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 
553 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
557 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
588 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 
555 aa  289  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 
593 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  34.53 
 
 
588 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
528 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  34.53 
 
 
588 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 
566 aa  287  3e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
549 aa  286  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
528 aa  286  9e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  34.94 
 
 
587 aa  286  1e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
554 aa  285  1e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  35.55 
 
 
602 aa  285  2e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 
528 aa  284  3e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.152e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>