18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6682 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1091    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  38.97 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  38.79 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  36.44 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  35.07 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  68.75 
 
 		 350 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  52.46 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  45.45 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  28.63 
 
 		 297 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  47.54 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  45.76 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  45.45 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  53.45 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  48.44 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  44.07 
 
 		 283 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  42.59 
 
 		 208 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  40.82 
 
 		 180 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>