More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6666 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  100 
 
 
540 aa  1095    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  74.58 
 
 
542 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  74.4 
 
 
540 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  73.1 
 
 
540 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.49 
 
 
551 aa  541  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  51.92 
 
 
548 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  52.6 
 
 
537 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  52.06 
 
 
535 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  50.85 
 
 
529 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  52.29 
 
 
539 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  51.87 
 
 
535 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  50.87 
 
 
518 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  50.1 
 
 
529 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  53.2 
 
 
539 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  51.48 
 
 
535 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  51.31 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  51.33 
 
 
536 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  50.75 
 
 
535 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  47.2 
 
 
533 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.19 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  48.47 
 
 
527 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.83 
 
 
540 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  41.86 
 
 
529 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  44.62 
 
 
528 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.62 
 
 
533 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.75 
 
 
536 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  41.94 
 
 
549 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  45.79 
 
 
542 aa  399  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  42.67 
 
 
528 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  43.16 
 
 
528 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  41.95 
 
 
525 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  38.18 
 
 
535 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  36.79 
 
 
540 aa  286  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  34.61 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34 
 
 
562 aa  259  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34 
 
 
562 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34 
 
 
562 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  33.46 
 
 
545 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.29 
 
 
568 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.03 
 
 
589 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.99 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.72 
 
 
658 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.12 
 
 
551 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.83 
 
 
542 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.3 
 
 
503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.84 
 
 
552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.31 
 
 
586 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.7 
 
 
561 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.14 
 
 
566 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  29.21 
 
 
572 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.66 
 
 
549 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.98 
 
 
489 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.07 
 
 
556 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 
566 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 
612 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 
572 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.48 
 
 
576 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.61 
 
 
572 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.37 
 
 
572 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.64 
 
 
584 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.31 
 
 
574 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  27.46 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  27.46 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  26.15 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.05 
 
 
573 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
574 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
584 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 
604 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.74 
 
 
588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.7 
 
 
573 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.52 
 
 
596 aa  163  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.66 
 
 
554 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 
584 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.27 
 
 
574 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.51 
 
 
573 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.27 
 
 
574 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.95 
 
 
570 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.81 
 
 
571 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  27.37 
 
 
623 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.99 
 
 
587 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.17 
 
 
572 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.32 
 
 
565 aa  160  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.71 
 
 
565 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.85 
 
 
573 aa  160  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.64 
 
 
572 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  26.72 
 
 
566 aa  160  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.64 
 
 
572 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.56 
 
 
593 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.56 
 
 
575 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.56 
 
 
575 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>