More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6638 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  100 
 
 
393 aa  822  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  57.69 
 
 
414 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  56.66 
 
 
413 aa  470  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  55.64 
 
 
413 aa  467  1e-130  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  55.64 
 
 
417 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  54.99 
 
 
431 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  55.05 
 
 
416 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  54.03 
 
 
415 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  52.98 
 
 
428 aa  440  1e-122  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  52.91 
 
 
427 aa  439  1e-122  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.22 
 
 
423 aa  439  1e-122  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  53.11 
 
 
426 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  51.81 
 
 
424 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  51.28 
 
 
439 aa  417  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.66 
 
 
326 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.02 
 
 
321 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  38.91 
 
 
384 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  40.13 
 
 
361 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  37.86 
 
 
370 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  39.25 
 
 
398 aa  198  2e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  39.38 
 
 
396 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.29 
 
 
381 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  37.95 
 
 
366 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  39.46 
 
 
387 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.39 
 
 
403 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.83 
 
 
405 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  35.57 
 
 
403 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.02848e-06  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.76 
 
 
440 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  7.85266e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.54 
 
 
400 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.64 
 
 
406 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.64 
 
 
406 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  35.22 
 
 
439 aa  165  1e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  35.35 
 
 
340 aa  165  1e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  35.25 
 
 
298 aa  164  2e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  35.25 
 
 
320 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  35.47 
 
 
299 aa  154  3e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  31.65 
 
 
360 aa  148  2e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  41.15 
 
 
1074 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.37 
 
 
725 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.93 
 
 
725 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.09 
 
 
245 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  35.84 
 
 
535 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  37.44 
 
 
615 aa  93.2  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  36.44 
 
 
539 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 
589 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.27 
 
 
600 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.47 
 
 
595 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  35.17 
 
 
599 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.64 
 
 
598 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  34.03 
 
 
756 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  34.22 
 
 
539 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.54 
 
 
593 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  36 
 
 
540 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.99 
 
 
736 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  35.02 
 
 
599 aa  85.9  1e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.59 
 
 
1006 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  34.59 
 
 
1065 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  32.85 
 
 
600 aa  85.9  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  35.24 
 
 
599 aa  85.1  2e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  34.05 
 
 
1065 aa  84.7  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  34.32 
 
 
599 aa  85.5  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  34.21 
 
 
736 aa  85.5  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  34.05 
 
 
1065 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 
1257 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  36.36 
 
 
1427 aa  85.5  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 
1313 aa  84.7  2e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  34.32 
 
 
599 aa  85.1  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.74 
 
 
589 aa  84.3  3e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.56 
 
 
1396 aa  84.3  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  37.23 
 
 
1338 aa  84.3  3e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.95 
 
 
595 aa  84.3  3e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  38.14 
 
 
1232 aa  84  4e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  34.02 
 
 
782 aa  84  4e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.02 
 
 
779 aa  84  4e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35 
 
 
1401 aa  84.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  34.02 
 
 
779 aa  84  4e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33.51 
 
 
1065 aa  84  5e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  34.76 
 
 
588 aa  83.6  5e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33.51 
 
 
1065 aa  84  5e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  33.51 
 
 
1065 aa  84  5e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.76 
 
 
588 aa  83.6  5e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  7.26752e-11 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  37.88 
 
 
1072 aa  83.6  6e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  35.29 
 
 
1418 aa  83.6  6e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  32.61 
 
 
600 aa  83.2  6e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.46 
 
 
595 aa  83.6  6e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 
732 aa  83.2  7e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.6 
 
 
1384 aa  83.2  7e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.29 
 
 
1418 aa  83.2  7e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  33.76 
 
 
599 aa  83.2  7e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.29 
 
 
1418 aa  83.2  7e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.29 
 
 
1418 aa  83.2  7e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  36.51 
 
 
376 aa  83.2  7e-15  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  33.61 
 
 
599 aa  83.2  7e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.29 
 
 
1418 aa  83.2  7e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  35.29 
 
 
1418 aa  83.2  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  32.61 
 
 
612 aa  83.2  7e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  35.29 
 
 
1398 aa  83.2  8e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  33.76 
 
 
599 aa  83.2  8e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  41.32 
 
 
1075 aa  83.2  8e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  33.76 
 
 
599 aa  83.2  8e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>