More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6455 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
314 aa  637  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  77.59 
 
 
313 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  78.08 
 
 
313 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  75.17 
 
 
314 aa  470  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  66.24 
 
 
325 aa  438  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  68.94 
 
 
317 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  64.63 
 
 
321 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  68.26 
 
 
322 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  61.41 
 
 
320 aa  416  1e-115  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  68.26 
 
 
323 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  64.07 
 
 
319 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0145  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  66.89 
 
 
324 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  33.9 
 
 
347 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  30.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.23 
 
 
383 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0057  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.32 
 
 
341 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.31 
 
 
324 aa  119  5e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.02 
 
 
338 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1079  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.64 
 
 
333 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0298231  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  29.14 
 
 
348 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.56 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  28.09 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5003  NMT1/THI5 like domain protein  29.21 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.17 
 
 
318 aa  89.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3665  substrate-binding protein involved in ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  24.45 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1088  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.69 
 
 
329 aa  85.1  1e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0066  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  26.6 
 
 
316 aa  84  3e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1366  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.84 
 
 
353 aa  84  3e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.0219132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.77 
 
 
326 aa  84  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  26.96 
 
 
326 aa  83.6  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  29.71 
 
 
320 aa  80.9  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06858e-06 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  29.91 
 
 
325 aa  80.5  3e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  29.08 
 
 
332 aa  80.5  3e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1361  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.24 
 
 
355 aa  80.1  4e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  normal  0.0792191 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.26 
 
 
333 aa  80.1  5e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  31.17 
 
 
328 aa  79.7  5e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  4.31055e-08 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  30 
 
 
349 aa  79.3  8e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
340 aa  79.3  8e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
341 aa  78.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3789  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25 
 
 
320 aa  79  1e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2535  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25 
 
 
333 aa  78.6  1e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0403  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  24.91 
 
 
328 aa  78.2  2e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  30.36 
 
 
328 aa  78.2  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter  23.26 
 
 
339 aa  76.6  5e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.553257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  28.06 
 
 
327 aa  76.6  5e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  30.8 
 
 
344 aa  76.3  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3974  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.16 
 
 
372 aa  75.9  8e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  31.98 
 
 
328 aa  75.1  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 
349 aa  75.1  1e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  31.98 
 
 
328 aa  75.1  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 
349 aa  74.3  2e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  31.47 
 
 
328 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.53 
 
 
343 aa  72.8  7e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.51 
 
 
338 aa  72.8  7e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  34.32 
 
 
328 aa  72.4  9e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  28.69 
 
 
328 aa  72.4  9e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.73 
 
 
341 aa  72  1e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.04129e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
341 aa  70.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3202  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.79 
 
 
346 aa  71.6  2e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  30.96 
 
 
328 aa  71.6  2e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  31.31 
 
 
342 aa  70.9  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  28.63 
 
 
349 aa  69.3  7e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  30.96 
 
 
328 aa  69.3  8e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1343  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 
355 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2686  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  28.16 
 
 
352 aa  68.6  1e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2399  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  26.87 
 
 
352 aa  68.6  1e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4500  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.71 
 
 
348 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.14 
 
 
346 aa  68.2  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0050  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  24.2 
 
 
351 aa  67.8  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.51 
 
 
331 aa  67.8  2e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  28.81 
 
 
340 aa  67.8  2e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2356  sulfonate ABC transporter periplasmic-binding protein  31.17 
 
 
378 aa  67.8  2e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.477529  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.48 
 
 
319 aa  67.4  3e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2621  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 
330 aa  67.4  3e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.48 
 
 
319 aa  67.4  3e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
347 aa  67.4  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  31.16 
 
 
337 aa  67  4e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.34 
 
 
329 aa  66.6  5e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  66.2  6e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
347 aa  66.6  6e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  31.16 
 
 
364 aa  66.2  7e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19360  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  29.89 
 
 
365 aa  66.2  7e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.429227  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  65.9  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  65.9  8e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  65.9  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  65.9  8e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  27.73 
 
 
330 aa  65.9  8e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  65.9  8e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.79 
 
 
344 aa  65.9  9e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  35.1 
 
 
330 aa  65.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1241  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.31 
 
 
360 aa  65.5  1e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.944959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6433  ABC transport system substrate-binding protein  26.67 
 
 
340 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.24 
 
 
340 aa  64.3  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1122  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
350 aa  65.1  2e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3067  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.42 
 
 
336 aa  65.1  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.38 
 
 
326 aa  65.1  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5927  ABC transport system substrate-binding protein  26.27 
 
 
340 aa  63.9  3e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3492  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic components  29.02 
 
 
360 aa  64.3  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5562  ABC transport system substrate-binding protein  26.27 
 
 
340 aa  63.9  3e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.27 
 
 
346 aa  63.9  3e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>