41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6447 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 322 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  52.48 
 
 		 317 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  53.29 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  51.25 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  54.64 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  53.16 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  55.05 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  55.52 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 342 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  51.67 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  49.17 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  49.33 
 
 		 342 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.34 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  23.38 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  25.51 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.65 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>