125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6422 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  100 
 
 
300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  67.01 
 
 
297 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  72.24 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  69.04 
 
 
295 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  68.68 
 
 
295 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  67.62 
 
 
294 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  63.29 
 
 
302 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  64.81 
 
 
303 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  63.64 
 
 
302 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  68.3 
 
 
274 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  61.19 
 
 
302 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  69.96 
 
 
309 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  62.59 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  60.62 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  61.4 
 
 
306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  59.86 
 
 
301 aa  355  6.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  59.72 
 
 
303 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  62.96 
 
 
305 aa  348  7e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  49.65 
 
 
325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.48 
 
 
330 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.48 
 
 
320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  48.4 
 
 
330 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.5 
 
 
330 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  47.55 
 
 
332 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  47.45 
 
 
276 aa  256  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  45.07 
 
 
310 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  43.88 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  43.04 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  38.33 
 
 
343 aa  188  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.45 
 
 
299 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.36 
 
 
317 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.36 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.96 
 
 
333 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.86 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.28 
 
 
318 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  37.17 
 
 
423 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.17 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.96 
 
 
315 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.91 
 
 
316 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.2 
 
 
317 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.91 
 
 
316 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.72 
 
 
337 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.99 
 
 
333 aa  168  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.62 
 
 
315 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.62 
 
 
315 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.08 
 
 
326 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.62 
 
 
315 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.8 
 
 
336 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.08 
 
 
326 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.33 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.86 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.7 
 
 
300 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.54 
 
 
326 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.42 
 
 
376 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  34.25 
 
 
317 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  35.38 
 
 
338 aa  142  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  33.83 
 
 
305 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  35.14 
 
 
333 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  35.71 
 
 
333 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  35.51 
 
 
333 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  33.45 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  33.1 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  31.75 
 
 
335 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  35.62 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  30.19 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  32.3 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  28.5 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  27.72 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  26.61 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  29.48 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  27.61 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  31.93 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  26.07 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  29.35 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  30.41 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  24.48 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  27.97 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  26.42 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  29.63 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  30.72 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  31.41 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  28.83 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  26.83 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.66 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  25.58 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  23.64 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  24.49 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.63 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.9 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  29.78 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  23.98 
 
 
313 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  32.3 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  30.37 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  26.63 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  24.64 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.61 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.5 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  26.67 
 
 
279 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  25 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  30.06 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>