More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6071 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
131 aa  267  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  64.89 
 
 
130 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  63.36 
 
 
130 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  65.89 
 
 
129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  65.6 
 
 
126 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  58.78 
 
 
131 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  58.02 
 
 
131 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  58.02 
 
 
131 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  54.1 
 
 
125 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  50.4 
 
 
129 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  43.85 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  45.11 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
134 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  43.28 
 
 
140 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  42.4 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  43.2 
 
 
137 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  42.52 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  42.52 
 
 
138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  43.31 
 
 
128 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  44.53 
 
 
141 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  41.8 
 
 
128 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  50 
 
 
125 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  39.23 
 
 
130 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  40.94 
 
 
130 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  40.88 
 
 
141 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  38.02 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  41.94 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
136 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  42.27 
 
 
133 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  36.51 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  36.15 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  37.3 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 
138 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.31 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  40.94 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.54 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.34 
 
 
388 aa  77.4  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.8 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.4 
 
 
480 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  36.72 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.78 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
393 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  36.13 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.71 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.25 
 
 
361 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.51 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  39.51 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  29.84 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.15 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.78 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  42.65 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.8 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.4 
 
 
480 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  32.43 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  31.19 
 
 
294 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.33 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.2 
 
 
346 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
480 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1453  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  27.2 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.14 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 
476 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  28.7 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  25.6 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>