More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6013 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 332 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  58.1 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  53.4 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  52.32 
 
 		 332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  53.95 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  45.31 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  45.71 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  42.63 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  37.86 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  35.99 
 
 		 344 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  37.78 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  38.06 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  39.08 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  37.78 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  33.93 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  38.94 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  39.58 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  35.67 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.86 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  37.1 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  30.03 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  36.19 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  31.15 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  33.04 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.56 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.17 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.95 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  28.04 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  31.67 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  31.49 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  35.29 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.71 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.83 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.37 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  36.51 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  33.21 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 379 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.07 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.5 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.71 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.75 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.38 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.89 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  31.13 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  30.53 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.52 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.39 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.3 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.03 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.22 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  30.28 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.5 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  32.83 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  32.93 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.62 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  26.07 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  33.94 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  32.71 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.25 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  33.94 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  32.71 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  32.71 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  32.71 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  32.64 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  32.74 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  27.27 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  29.6 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  24.44 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  23.57 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.69 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  34.88 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.27 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  30.97 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.01 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.58 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  31.09 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.02 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.58 
 
 		 351 aa  96.3  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.85 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  34.03 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>