45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5978 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5978  heme-binding protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1414  SOUL heme-binding protein  44.75 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0086  SOUL heme-binding protein  40.82 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502327  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1732  SOUL heme-binding protein  44.81 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0388599  normal  0.579587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0404  SOUL heme-binding protein  40 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.460046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2389  SOUL heme-binding protein  39.89 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2940  SOUL heme-binding protein  37.68 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2896  SOUL heme-binding protein  37.68 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2926  SOUL heme-binding protein  38 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824074  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1702  SOUL heme-binding protein  38.61 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.047205  normal  0.584575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0124  SOUL heme-binding protein  39.66 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2407  SOUL heme-binding protein  36.92 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3219  SOUL heme-binding protein  42.39 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2155  SOUL heme-binding protein  36.72 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.798949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2804  SOUL heme-binding protein  36.72 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0157  SOUL heme-binding protein  40.46 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1785  SOUL heme-binding protein  34.13 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.216897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2884  SOUL heme-binding protein  41.62 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0215934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1349  putative SOUL heme-binding protein  36.5 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2566  SOUL heme-binding protein  34.34 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0552192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3628  SOUL heme-binding protein  42.59 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146783  normal  0.903477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0864  hypothetical protein  37.1 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2524  SOUL heme-binding protein  38.29 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2357  SOUL heme-binding protein  37.23 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1762  SOUL heme-binding protein  34.63 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.744804 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0544  SOUL heme-binding protein  42.86 
 
 		 115 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.301676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0891  SOUL heme-binding protein  31.11 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3007  SOUL heme-binding protein  34.38 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4115  SOUL heme-binding protein  32.96 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2304  SOUL heme-binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  91.3  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00025626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1935  SOUL heme-binding protein  31.18 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1279  SOUL heme-binding protein  31.55 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1033  SOUL heme-binding protein  34.05 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1687  hypothetical protein  30.36 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00350109 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46002  predicted protein  29.95 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0390723  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35858  predicted protein  29.95 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000296008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0854  SOUL heme-binding protein  29.14 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3441  SOUL heme-binding protein  29.73 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40872  predicted protein  29.63 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.471917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4266  SOUL heme-binding protein  33.33 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.409144 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30678  predicted protein  27.98 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800735  normal  0.996732 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37136  predicted protein  28.08 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3308  hypothetical protein  24.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2809  hypothetical protein  24.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0123  hypothetical protein  26.21 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.142779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>