24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5944 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  351  3e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  42.94 
 
 
166 aa  135  3e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  42.76 
 
 
161 aa  125  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  41.61 
 
 
176 aa  126  2e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  38.96 
 
 
170 aa  118  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  38.96 
 
 
170 aa  117  1e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  43.38 
 
 
163 aa  114  7e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  42.34 
 
 
163 aa  113  1e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  42.34 
 
 
163 aa  112  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  41.61 
 
 
164 aa  111  4e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  43.57 
 
 
185 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  39.24 
 
 
161 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  38.27 
 
 
174 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  38.73 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  36.3 
 
 
169 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  35.04 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  82.8  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  34.1 
 
 
189 aa  82  4e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  34.29 
 
 
177 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  32.21 
 
 
177 aa  76.6  1e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  32.21 
 
 
177 aa  76.3  2e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  31.93 
 
 
191 aa  72.4  3e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  28 
 
 
314 aa  61.2  6e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  51.06 
 
 
58 aa  50.8  9e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>