More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5909 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  100 
 
 
107 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  75.24 
 
 
106 aa  167  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.15 
 
 
106 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.05 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
106 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.05 
 
 
106 aa  123  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  59.05 
 
 
106 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  59.05 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  52.83 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.21 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  52.83 
 
 
106 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
110 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
105 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
107 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
122 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
122 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
110 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
127 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  42.45 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
110 aa  99  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
108 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.43 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  47.66 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
127 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
108 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  42.45 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.99 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  41.51 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3997  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914293  normal  0.0156155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  47.17 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.62 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
206 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.99 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  46.23 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1952  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  43.4 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000360593  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5430  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  42.06 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1640  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894847  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5953  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2141  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2124  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  46.23 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.6 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2142  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  47.17 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.75 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.12 
 
 
115 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.86 
 
 
108 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
108 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  45.71 
 
 
108 aa  93.6  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1706  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2597  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2731  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1877  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1487  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.08 
 
 
116 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2653  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3105  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  45.71 
 
 
108 aa  93.6  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2215  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.28 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2375  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  44.34 
 
 
107 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
107 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  46.23 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>