28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5898 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  71.25 
 
 
81 aa  124  4e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  67.61 
 
 
77 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  66.22 
 
 
85 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  66.2 
 
 
76 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  62.5 
 
 
79 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  66.22 
 
 
82 aa  98.2  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  63.01 
 
 
85 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  54.88 
 
 
84 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  56.58 
 
 
89 aa  93.6  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  56.58 
 
 
92 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  56.41 
 
 
83 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  57.69 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  57.69 
 
 
103 aa  82  3e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  38.67 
 
 
99 aa  48.9  2e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  38.67 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  36 
 
 
99 aa  47  8e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  34.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  37.33 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  36.62 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  33.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  33.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  38.67 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  33.8 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  36.36 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  33.33 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.04465e-05  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  35.62 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  37.33 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>