149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5890 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  71.53 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  63.57 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  67.77 
 
 		 137 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  57.36 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  55.65 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  51.59 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  49.21 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  50 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  45.08 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  43.55 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  43.55 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  45.97 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  44.26 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  46.88 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  42.74 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  42.5 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  43.2 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  44.7 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  43.2 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  43.2 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  45.08 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  43.2 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  40.34 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  42.74 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  44 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  42.74 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  41.46 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  42.74 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  42.74 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  42.74 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  42.74 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  43.44 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  40 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  40.98 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  41.94 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  41.94 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  41.94 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  41.13 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  41.94 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  41.67 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  42.5 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  39.17 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  41.13 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  39.17 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  42.75 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  38.33 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  38.33 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  39.17 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  39.17 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  39.17 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  39.84 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  39.68 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  38.33 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  38.33 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  39.52 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  39.68 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  42.11 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  40.98 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  38.33 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  41.32 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  42.62 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  38.58 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  40.98 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  44.35 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  39.52 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  39.37 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  38.58 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  37.5 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  39.5 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  39.67 
 
 		 137 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  36.5 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  36.8 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  43.12 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  36.07 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  37.11 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.25 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.25 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  36 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  35.25 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  35.88 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  45.45 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  35.25 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.25 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.25 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.25 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.25 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  40 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  34.43 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  36.92 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  32.86 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  34.96 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  43.56 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  39.36 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  43.43 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>