More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5808 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
1003 aa  681  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
1002 aa  712  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.07 
 
 
1390 aa  692  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.4 
 
 
1385 aa  713  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1048 aa  692  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.76 
 
 
1646 aa  833  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.15 
 
 
1631 aa  814  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.73 
 
 
1361 aa  686  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
1118 aa  728  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.07 
 
 
1390 aa  692  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.94 
 
 
1426 aa  1095  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.37 
 
 
1651 aa  850  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  60.08 
 
 
1427 aa  1101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.07 
 
 
1390 aa  691  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
1383 aa  679  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.93 
 
 
1514 aa  736  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
1131 aa  820  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 
1140 aa  778  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.26 
 
 
1415 aa  1105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.27 
 
 
1370 aa  657  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
1010 aa  716  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.45 
 
 
1406 aa  808  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 
1248 aa  651  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  45.88 
 
 
1202 aa  695  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.93 
 
 
1514 aa  737  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  100 
 
 
1299 aa  2610  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
1153 aa  642  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  1.7622e-06 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.58 
 
 
1152 aa  685  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
1711 aa  739  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.91 
 
 
1431 aa  881  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
1559 aa  680  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
1287 aa  715  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 
1383 aa  607  1e-172  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
1013 aa  605  1e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  43.87 
 
 
919 aa  531  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.5 
 
 
821 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.76 
 
 
1051 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
822 aa  506  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.66 
 
 
795 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.65 
 
 
1645 aa  455  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
1014 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.44 
 
 
587 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.08 
 
 
584 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.47 
 
 
585 aa  408  1e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  57.44 
 
 
587 aa  410  1e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.8 
 
 
1011 aa  403  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  56.17 
 
 
722 aa  400  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.47 
 
 
944 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.11 
 
 
943 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.64 
 
 
946 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.03 
 
 
899 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.01 
 
 
888 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
1059 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 
1224 aa  397  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.71 
 
 
942 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 
742 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.43 
 
 
1057 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.42 
 
 
785 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.32 
 
 
809 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.87 
 
 
581 aa  389  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 
946 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.19 
 
 
783 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  55.19 
 
 
783 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.73 
 
 
812 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  54.59 
 
 
632 aa  386  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.23 
 
 
703 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 
1076 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.4 
 
 
826 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
814 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.6 
 
 
684 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.5 
 
 
693 aa  379  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  54.86 
 
 
632 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  49.88 
 
 
684 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 
764 aa  379  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  52.94 
 
 
638 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  53.37 
 
 
716 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  31.87 
 
 
1614 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.55 
 
 
736 aa  373  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
837 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.17 
 
 
727 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.22 
 
 
708 aa  365  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.64 
 
 
720 aa  363  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 
732 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.52 
 
 
727 aa  359  2e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 
727 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  41.13 
 
 
793 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  47.67 
 
 
796 aa  344  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 
776 aa  343  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  34.92 
 
 
1816 aa  339  2e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1165 aa  334  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.02 
 
 
1180 aa  330  1e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
1156 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
975 aa  316  2e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
630 aa  314  7e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  36.83 
 
 
1172 aa  313  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
664 aa  307  9e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
663 aa  300  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  35.75 
 
 
695 aa  300  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
696 aa  298  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
695 aa  297  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>