More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5760 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  70.54 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  73.03 
 
 		 242 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  70.42 
 
 		 243 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  68.6 
 
 		 243 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  69.01 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  62.45 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  63.56 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  48.54 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  43.91 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  40.43 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  40.74 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.08 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  40.87 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  43.89 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  40.33 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  40.87 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  37.67 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  36.91 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  40.69 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  37.79 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  37.36 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  38.93 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.59 
 
 		 339 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.02 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 338 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.37 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 152 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  38.19 
 
 		 154 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.93 
 
 		 149 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 		 132 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  34.87 
 
 		 147 aa  91.7  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 152 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  31.03 
 
 		 193 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.27 
 
 		 332 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.11 
 
 		 153 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 155 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  36.5 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.84 
 
 		 427 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  32.43 
 
 		 153 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  34.42 
 
 		 150 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.88 
 
 		 152 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.17 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  34.72 
 
 		 155 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  34.46 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  32.98 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  34.67 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.52 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.81 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.09 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.49 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  29.58 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.47 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.97 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.53 
 
 		 769 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.88 
 
 		 903 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.27 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  29.07 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  36.69 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  30.7 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  29.29 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  29.38 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  30.22 
 
 		 845 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.51 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  30.87 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.55 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.55 
 
 		 153 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  34.53 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 148 aa  72  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.66 
 
 		 141 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.46 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  30.61 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.97 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.92 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.08 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  27.78 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>