More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5728 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  813    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  75.19 
 
 
399 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  73.54 
 
 
415 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  68.96 
 
 
401 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  69.79 
 
 
400 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  65.27 
 
 
401 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  66.84 
 
 
398 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  64.27 
 
 
422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  63.8 
 
 
402 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  61.28 
 
 
401 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  64.23 
 
 
391 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  61.62 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  64.49 
 
 
391 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  61.82 
 
 
406 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  63.97 
 
 
391 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  60.88 
 
 
406 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  60.96 
 
 
406 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  60.3 
 
 
406 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  59.85 
 
 
406 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  58.21 
 
 
398 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  56.89 
 
 
413 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  59.07 
 
 
403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  58.21 
 
 
414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  57.51 
 
 
394 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  61.05 
 
 
397 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  60.79 
 
 
397 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  61.1 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  61.52 
 
 
397 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  50 
 
 
396 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  50.39 
 
 
397 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  48.97 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  47.48 
 
 
417 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  47.68 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  45.06 
 
 
415 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  47.63 
 
 
421 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  47.42 
 
 
402 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  47.42 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  46.85 
 
 
402 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  44.39 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  44.3 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  42.53 
 
 
396 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  42.86 
 
 
396 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  45.24 
 
 
395 aa  319  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  43.47 
 
 
400 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  42.86 
 
 
398 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  41.86 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  43.42 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  40.78 
 
 
395 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  42.34 
 
 
395 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  41.62 
 
 
396 aa  292  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  42.94 
 
 
383 aa  289  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  39.79 
 
 
395 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  41.04 
 
 
395 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.94 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.94 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  40.31 
 
 
388 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  39.18 
 
 
393 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.66 
 
 
387 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  38.89 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.94 
 
 
387 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  40.83 
 
 
382 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  39.06 
 
 
384 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  38.66 
 
 
387 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.22 
 
 
385 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  40.62 
 
 
382 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.17 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  39.83 
 
 
386 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.83 
 
 
387 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  36.15 
 
 
384 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  36.69 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.12 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  38.06 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  37.28 
 
 
404 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.04 
 
 
385 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.43 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.62 
 
 
382 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  40.5 
 
 
397 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  34.2 
 
 
384 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  36.97 
 
 
379 aa  226  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.1 
 
 
362 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.94 
 
 
384 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  39 
 
 
362 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  39.78 
 
 
382 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.58 
 
 
383 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  34.49 
 
 
379 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.94 
 
 
363 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  37.5 
 
 
381 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  38.72 
 
 
362 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.75 
 
 
382 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.26 
 
 
384 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.46 
 
 
386 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  34.7 
 
 
396 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  36.48 
 
 
382 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  35.29 
 
 
379 aa  222  8e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  36.05 
 
 
380 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.7 
 
 
382 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  33.42 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.51 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  37.79 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.82 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>