More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5726 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  676  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  56.17 
 
 
333 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  53.9 
 
 
345 aa  357  1e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  52.61 
 
 
341 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  49.23 
 
 
341 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  50.65 
 
 
337 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  47.22 
 
 
337 aa  336  3e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  48.88 
 
 
337 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  45.99 
 
 
337 aa  327  2e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  48.56 
 
 
349 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  47.11 
 
 
365 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.43052e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  47.21 
 
 
337 aa  303  2e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  43.87 
 
 
328 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  41.54 
 
 
329 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  41.14 
 
 
328 aa  233  4e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.16 
 
 
341 aa  140  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 
332 aa  139  5e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  27.81 
 
 
326 aa  130  2e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  29.39 
 
 
336 aa  128  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  25.45 
 
 
330 aa  122  1e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  27.3 
 
 
322 aa  120  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  27.38 
 
 
350 aa  119  8e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  26.44 
 
 
328 aa  118  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
324 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 
324 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  26.97 
 
 
322 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.18 
 
 
324 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  25.17 
 
 
326 aa  115  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  26.87 
 
 
346 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  25.77 
 
 
334 aa  112  1e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  24.5 
 
 
308 aa  112  1e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  29.19 
 
 
337 aa  110  4e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  27.27 
 
 
346 aa  108  9e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  25.25 
 
 
321 aa  108  9e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  26.77 
 
 
326 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  28.39 
 
 
332 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  26.86 
 
 
322 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  29.05 
 
 
333 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  23.26 
 
 
319 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  27.6 
 
 
326 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  24.59 
 
 
326 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  23.84 
 
 
319 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  26.35 
 
 
325 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  25.6 
 
 
325 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  25.68 
 
 
325 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  25.41 
 
 
332 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
327 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  25.99 
 
 
356 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  24.76 
 
 
311 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  25.24 
 
 
326 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  27.57 
 
 
330 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  30.91 
 
 
329 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  26.33 
 
 
333 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  25.24 
 
 
326 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  25.41 
 
 
326 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  26.35 
 
 
328 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  22.92 
 
 
319 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  22.92 
 
 
319 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6308  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  23.68 
 
 
325 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  26.45 
 
 
326 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  25.25 
 
 
318 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.84229e-06  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  26.73 
 
 
321 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  24.92 
 
 
326 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  30.18 
 
 
329 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  25.3 
 
 
323 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  27.78 
 
 
327 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  27.78 
 
 
325 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  24.43 
 
 
332 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  24.55 
 
 
330 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  24.77 
 
 
325 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  27.34 
 
 
327 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.74239e-07  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  24.92 
 
 
319 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  30.83 
 
 
323 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  26.99 
 
 
327 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  25.16 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  26.11 
 
 
328 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  27.06 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  26.16 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  27.91 
 
 
322 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  99  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  24.85 
 
 
329 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  25.8 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  25.49 
 
 
333 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  25.5 
 
 
315 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.22 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  23.88 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  29.89 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  25.18 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  26.95 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  24.46 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  25.93 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  23.59 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  25.81 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  28.73 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 
327 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  25.72 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>