19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5656 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  27.86 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  29.1 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  30.66 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  30.3 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  32.8 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  33.58 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  30.94 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  23.74 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  24.68 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  25.9 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  26.09 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  25.36 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  25.66 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>