More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5632 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  52.84 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  53.71 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  51.97 
 
 		 305 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.54 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  43.04 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  45.26 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 348 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3884  nucleotidyl transferase  39.08 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.883067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 347 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.62 
 
 		 347 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  39.11 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  31.8 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 326 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  35.22 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.38 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.96 
 
 		 820 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 		 357 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 		 821 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  31.76 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 854 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  30.2 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.63 
 
 		 837 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 818 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.41 
 
 		 397 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.47 
 
 		 358 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.08 
 
 		 357 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 		 835 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 		 363 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  32.48 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  25.96 
 
 		 785 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 832 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.02 
 
 		 840 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 		 833 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.03 
 
 		 354 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.84 
 
 		 357 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.64 
 
 		 830 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  30.51 
 
 		 370 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.47 
 
 		 355 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 400 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.8 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.05 
 
 		 832 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  31.03 
 
 		 830 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.19 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.96 
 
 		 784 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.9 
 
 		 832 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.57 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.96 
 
 		 784 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.43 
 
 		 828 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  35.24 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 843 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 843 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.65 
 
 		 828 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.22 
 
 		 356 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.11 
 
 		 358 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 827 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.05 
 
 		 842 aa  98.6  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.81 
 
 		 836 aa  98.2  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  31.11 
 
 		 355 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  29.29 
 
 		 841 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  29.24 
 
 		 370 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 		 784 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.48 
 
 		 400 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 		 784 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 		 784 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.53 
 
 		 784 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.53 
 
 		 784 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 		 828 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.53 
 
 		 784 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 370 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.13 
 
 		 354 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  26.36 
 
 		 784 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  32.33 
 
 		 359 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  28.31 
 
 		 388 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.57 
 
 		 842 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.33 
 
 		 842 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  25.94 
 
 		 784 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 361 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.33 
 
 		 712 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  30.74 
 
 		 362 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.66 
 
 		 841 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  26.15 
 
 		 381 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 		 357 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.98 
 
 		 836 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.11 
 
 		 392 aa  95.5  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  29.39 
 
 		 352 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>