30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5623 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  58.84 
 
 
313 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  58.49 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  59.87 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  55.94 
 
 
319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  59.55 
 
 
319 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  32.91 
 
 
339 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  26.25 
 
 
326 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.61 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  28.43 
 
 
319 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  25.4 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  25.4 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  27.6 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  26.38 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  27.39 
 
 
314 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  26.32 
 
 
298 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.91 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  29.43 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  24.13 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  22.57 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  20.7 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  24.92 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  23.78 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  21.78 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1029  hypothetical protein  28.7 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  27.7 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  27.61 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  20.69 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  46.94 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>