More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5619 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  100 
 
 		 739 aa  1502    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  56.87 
 
 		 740 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  62.14 
 
 		 742 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  71.58 
 
 		 739 aa  1059    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  68.16 
 
 		 739 aa  987    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 		 713 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  41.22 
 
 		 715 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.24 
 
 		 937 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 754 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.26 
 
 		 699 aa  317  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.29 
 
 		 754 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.24 
 
 		 1106 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 789 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 824 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 828 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 828 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 708 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1106 aa  293  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 833 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.39 
 
 		 708 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 833 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 3035 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 717 aa  286  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 1714 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 693 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 717 aa  282  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 828 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 968 aa  277  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.5 
 
 		 667 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 734 aa  274  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 822 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 		 589 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 789 aa  266  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1094 aa  266  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 3560 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 4489 aa  260  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 796 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 718 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 619 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  32.84 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.39 
 
 		 529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 598 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 647 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 821 aa  249  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.07 
 
 		 816 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.32 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 732 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  33.45 
 
 		 790 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.7 
 
 		 1221 aa  246  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 974 aa  246  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1085 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.44 
 
 		 589 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 633 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.75 
 
 		 723 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 595 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  33.66 
 
 		 780 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 780 aa  243  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 909 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 740 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 779 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 		 790 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 627 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.67 
 
 		 596 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.13 
 
 		 781 aa  230  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 761 aa  229  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.07 
 
 		 797 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 750 aa  220  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.93 
 
 		 1415 aa  217  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 727 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.98 
 
 		 921 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 1143 aa  211  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  29.75 
 
 		 553 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 1116 aa  209  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 633 aa  207  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 667 aa  204  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 647 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 739 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 1144 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  31.22 
 
 		 637 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 724 aa  187  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 750 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.35 
 
 		 630 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 654 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 616 aa  181  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 706 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 		 793 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 733 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 632 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  29.74 
 
 		 633 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.06 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.11 
 
 		 1694 aa  163  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 618 aa  163  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  31.11 
 
 		 624 aa  163  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>