More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5500 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  100 
 
 		 291 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  36.08 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  30.03 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  27.43 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  27.43 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.41 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.47 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.52 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  28.37 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.42 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  27 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.6 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  25.68 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.34 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  28.83 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.46 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  26.71 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  23.95 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.35 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  27.93 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  26.38 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.89 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.55 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.39 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.92 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.3 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.3 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.3 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  26.79 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.88 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  28.38 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.94 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.94 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  27.2 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  28.46 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>