More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5377 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  90.09 
 
 		 245 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  66.4 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  68.83 
 
 		 238 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  70.34 
 
 		 238 aa  324  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  70.82 
 
 		 240 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  69.49 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  64.23 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  65.67 
 
 		 238 aa  314  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  63.27 
 
 		 245 aa  311  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  61.64 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  64.08 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  67.1 
 
 		 240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  63.67 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  63.2 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  64.07 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  62.23 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  61.67 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  64.07 
 
 		 251 aa  301  7.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  64.41 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  65.4 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  64.78 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  65.52 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  64.5 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  62.5 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  61.47 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  62.34 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  64.94 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  61.5 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  60.78 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  66.67 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  63.36 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  59.13 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.68 
 
 		 236 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  52.91 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  51.09 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  56.44 
 
 		 236 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  52.34 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.19 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  52.86 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  53.68 
 
 		 234 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  48.26 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  51.1 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  51.98 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  48.73 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  49.34 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  51.34 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  55.34 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  48.02 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.19 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  52.91 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 235 aa  228  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 233 aa  225  7e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  49.12 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.43 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  47.9 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.5 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.19 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.87 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.39 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.69 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.87 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.46 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.95 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.84 
 
 		 300 aa  197  9e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  45.76 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46.15 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  46.96 
 
 		 288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.81 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  48.61 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  38.03 
 
 		 604 aa  194  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.95 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  44.25 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  45.92 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.61 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>