More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5366 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  100 
 
 
297 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.49 
 
 
307 aa  398  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  73.54 
 
 
320 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.61 
 
 
304 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  68.25 
 
 
301 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  67.27 
 
 
306 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.52 
 
 
305 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.52 
 
 
305 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.32 
 
 
306 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  62.55 
 
 
310 aa  304  1e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  41.05 
 
 
301 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  38.14 
 
 
319 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  39.08 
 
 
314 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.52 
 
 
320 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  36.86 
 
 
304 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.49 
 
 
301 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  36.97 
 
 
319 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.36 
 
 
321 aa  147  2e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  35.36 
 
 
321 aa  146  4e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.99 
 
 
301 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  32.39 
 
 
304 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  37.02 
 
 
290 aa  140  2e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  33.09 
 
 
314 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  35.61 
 
 
305 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  38.95 
 
 
316 aa  135  1e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.84 
 
 
307 aa  128  1e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.51 
 
 
312 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.51 
 
 
312 aa  119  5e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
310 aa  118  1e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  31.43 
 
 
298 aa  116  4e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  33.81 
 
 
310 aa  115  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
310 aa  115  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.39 
 
 
300 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  35.27 
 
 
308 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  30.74 
 
 
292 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32 
 
 
311 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  30.34 
 
 
297 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.3 
 
 
298 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.22 
 
 
296 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.41 
 
 
335 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  29.73 
 
 
294 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  31.43 
 
 
312 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  33.83 
 
 
301 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 
313 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  34.03 
 
 
301 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  23.93 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  32.64 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  32.64 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.29 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.45 
 
 
379 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  31.85 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.11 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  31.07 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  32.13 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  32.12 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.75 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.56 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.03 
 
 
294 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.51 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.6 
 
 
298 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.56 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.12 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.6 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  31.88 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  29.25 
 
 
296 aa  89  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  31.27 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.25 
 
 
296 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.25 
 
 
296 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  28.28 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.07 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.62 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.94 
 
 
310 aa  85.5  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.82 
 
 
310 aa  85.1  1e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  30.27 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  31.27 
 
 
364 aa  85.1  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  32.23 
 
 
295 aa  85.1  1e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.82 
 
 
310 aa  85.1  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  30.27 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.85 
 
 
301 aa  84.7  2e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  31.35 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.14 
 
 
297 aa  84.7  2e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
326 aa  84.7  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>