More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5356 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  42.68 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  45.83 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  37.79 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.8 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.93 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  33.52 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  33.53 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.09 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  34.12 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  37.41 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.02 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  34.27 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  36.78 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.37 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.26 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  35.98 
 
 		 188 aa  95.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  34.15 
 
 		 189 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.07 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  32.97 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  36.21 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  30.59 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.9 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.32 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.32 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.32 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  32.32 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  32.93 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  31.71 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0153  nickel-dependent hydrogenase b- type cytochrome subunit  33.53 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.520725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  31.71 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  32.39 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  37.43 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  30.49 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  33.52 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  34.76 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.1 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.32 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  29.44 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.71 
 
 		 186 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  36.87 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  33.33 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  33.13 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  34.81 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.15 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  33.14 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  33.14 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  31.25 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.54 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  33.7 
 
 		 175 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  32.93 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  35.67 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  34.52 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.22 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  32.97 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  34.52 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  33.53 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.73 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  32.22 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  31.84 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  32.56 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  35.06 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  34.44 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  30.86 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  36.31 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.81 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.86 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  33.52 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  30.86 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  31.1 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  31.14 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.12 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.12 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  32.93 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.71 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  31.49 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  34.34 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  31.67 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  31.14 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.12 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  34.15 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.71 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  28.49 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.95 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  31.46 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  32.78 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  30.17 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  30.46 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  32.4 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  32.24 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.14 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  29.94 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2101  cytochrome B561  33.54 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000195  cytochrome b561  34.08 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000187144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>