121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5268 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1078 aa  2034    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  55.31 
 
 		 2407 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  50.28 
 
 		 1019 aa  596  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  56.6 
 
 		 814 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  47.75 
 
 		 1180 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.65 
 
 		 882 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.49 
 
 		 1081 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  49.26 
 
 		 1130 aa  536  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  49.49 
 
 		 1111 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.51 
 
 		 907 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  51.17 
 
 		 987 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.11 
 
 		 1532 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.78 
 
 		 1177 aa  295  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  39.11 
 
 		 678 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.49 
 
 		 1029 aa  128  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  25.58 
 
 		 1508 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.79 
 
 		 1285 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  42.14 
 
 		 190 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.03 
 
 		 1519 aa  104  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 1550 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 		 2003 aa  97.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.01 
 
 		 1119 aa  95.9  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1881 aa  94.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.86 
 
 		 3506 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.88 
 
 		 1848 aa  92.8  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25.79 
 
 		 991 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.11 
 
 		 1001 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  26.55 
 
 		 2396 aa  89.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.19 
 
 		 1489 aa  89.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 2371 aa  88.6  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 1459 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 2365 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 		 2366 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  26.21 
 
 		 2346 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.41 
 
 		 1179 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  25.43 
 
 		 3954 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 1458 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.23 
 
 		 1571 aa  83.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 		 1152 aa  83.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  38.32 
 
 		 1971 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  41.18 
 
 		 994 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.02 
 
 		 980 aa  82.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  39.46 
 
 		 1741 aa  81.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.27 
 
 		 1227 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.22 
 
 		 1357 aa  81.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.58 
 
 		 1011 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.8 
 
 		 1156 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  24.06 
 
 		 4238 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.13 
 
 		 950 aa  78.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  24.39 
 
 		 995 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.5 
 
 		 1125 aa  75.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  23.46 
 
 		 1028 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  39.06 
 
 		 3420 aa  75.1  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 		 4238 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  25.71 
 
 		 3822 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  38.54 
 
 		 3415 aa  72.8  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.76 
 
 		 1369 aa  72.4  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.22 
 
 		 2906 aa  71.6  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.52 
 
 		 985 aa  71.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  25.36 
 
 		 1055 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.83 
 
 		 915 aa  70.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1056 aa  68.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.62 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  39.22 
 
 		 2578 aa  68.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.98 
 
 		 2642 aa  68.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  32.11 
 
 		 983 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.91 
 
 		 1154 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.27 
 
 		 1769 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.54 
 
 		 926 aa  66.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.16 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.74 
 
 		 942 aa  65.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  25.88 
 
 		 947 aa  65.1  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  37.97 
 
 		 852 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 		 913 aa  63.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.15 
 
 		 1322 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  22.74 
 
 		 2848 aa  61.6  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  38.65 
 
 		 1113 aa  61.6  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  31.79 
 
 		 1001 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.43 
 
 		 2926 aa  60.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.47 
 
 		 972 aa  60.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.5 
 
 		 1530 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  25.25 
 
 		 1016 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  23.36 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  24.64 
 
 		 816 aa  60.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 1108 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.79 
 
 		 995 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.68 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  31.19 
 
 		 1033 aa  58.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  40.94 
 
 		 1300 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.17 
 
 		 1006 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  35.5 
 
 		 1882 aa  56.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 1172 aa  55.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 1782 aa  56.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.19 
 
 		 986 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.73 
 
 		 3391 aa  55.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1165 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1165 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.46 
 
 		 919 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  24.8 
 
 		 763 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.94 
 
 		 641 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>