222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4926 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2266  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  67.98 
 
 
537 aa  732    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.419568  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  100 
 
 
551 aa  1125    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  55.98 
 
 
581 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3812  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.45 
 
 
568 aa  548  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135188  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.9 
 
 
568 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0518569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1105  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.72 
 
 
568 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.87 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  32.66 
 
 
1277 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.83 
 
 
578 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  31.17 
 
 
585 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.81 
 
 
577 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.13 
 
 
580 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.8 
 
 
601 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  32.29 
 
 
566 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.68 
 
 
582 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
519 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.08 
 
 
575 aa  246  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.16 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.27 
 
 
577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.96 
 
 
564 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.65 
 
 
527 aa  240  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.98 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.6 
 
 
531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.31 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 
616 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.81 
 
 
577 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.74 
 
 
528 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.21 
 
 
541 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.62 
 
 
629 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.11 
 
 
529 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  31.96 
 
 
565 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.85 
 
 
585 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.11 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.68 
 
 
561 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.61 
 
 
524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.44 
 
 
556 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.73 
 
 
534 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.63 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.35 
 
 
564 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.81 
 
 
510 aa  217  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.8 
 
 
671 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  31.42 
 
 
563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.03 
 
 
514 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  33.4 
 
 
577 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.22 
 
 
568 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.14 
 
 
586 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  32.22 
 
 
537 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.22 
 
 
597 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.64 
 
 
514 aa  207  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  29.72 
 
 
600 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  32.8 
 
 
845 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.83 
 
 
583 aa  206  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
539 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.57 
 
 
657 aa  204  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.14 
 
 
511 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.53 
 
 
598 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.16 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 
513 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
544 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.8 
 
 
634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.52 
 
 
681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.09 
 
 
557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.31 
 
 
548 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.86 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.55 
 
 
579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  31.08 
 
 
611 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.19 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.96 
 
 
548 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.67 
 
 
624 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.74 
 
 
517 aa  194  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.71 
 
 
552 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  28.95 
 
 
574 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.28 
 
 
613 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2849  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.89 
 
 
628 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0802  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.46 
 
 
561 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36294  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.27 
 
 
594 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.37 
 
 
584 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  26.32 
 
 
647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3306  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.84 
 
 
561 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32832  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.21 
 
 
512 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.21 
 
 
589 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  28.32 
 
 
640 aa  183  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  31.75 
 
 
558 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.46 
 
 
558 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.69 
 
 
558 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  27.48 
 
 
579 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.48 
 
 
632 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  29.09 
 
 
1271 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.2 
 
 
1206 aa  176  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.47 
 
 
660 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.35 
 
 
1293 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.09 
 
 
633 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  27.35 
 
 
674 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  28.47 
 
 
582 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  28.83 
 
 
576 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.36 
 
 
1258 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2207  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.64 
 
 
559 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00887256  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.45 
 
 
599 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.03 
 
 
1206 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>