More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4886 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  100 
 
 
409 aa  835  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  72.07 
 
 
406 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  72.07 
 
 
402 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  61.74 
 
 
419 aa  468  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  58.77 
 
 
406 aa  469  1e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.5 
 
 
418 aa  468  1e-130  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.5 
 
 
418 aa  468  1e-130  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  61.19 
 
 
429 aa  465  1e-130  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  60.05 
 
 
424 aa  465  1e-130  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  58.81 
 
 
418 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  62.03 
 
 
414 aa  461  1e-128  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  55.34 
 
 
419 aa  446  1e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  56.81 
 
 
437 aa  441  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  52.63 
 
 
453 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  54.96 
 
 
437 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  52.66 
 
 
425 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  53.47 
 
 
414 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  54.67 
 
 
431 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  55.88 
 
 
451 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.47 
 
 
415 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  55.32 
 
 
430 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  55.35 
 
 
445 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  55.35 
 
 
449 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.72 
 
 
451 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  54.23 
 
 
427 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.2 
 
 
425 aa  408  1e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  54.55 
 
 
449 aa  405  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  52.25 
 
 
431 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  51.65 
 
 
448 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  52.09 
 
 
423 aa  400  1e-110  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  51.73 
 
 
405 aa  398  1e-110  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  50.67 
 
 
425 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.13 
 
 
456 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  49.6 
 
 
425 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  49.63 
 
 
414 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  51.28 
 
 
457 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  51.04 
 
 
440 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  51.43 
 
 
443 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  49.87 
 
 
457 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.27 
 
 
414 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  51.34 
 
 
428 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  51.34 
 
 
428 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  46.57 
 
 
431 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  46.25 
 
 
427 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  49.74 
 
 
420 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.68 
 
 
430 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  47.64 
 
 
425 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  44.47 
 
 
445 aa  338  1e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  37.23 
 
 
376 aa  174  3e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.23 
 
 
372 aa  166  1e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.36 
 
 
369 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.64 
 
 
414 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.04 
 
 
400 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  34.54 
 
 
420 aa  153  6e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.97 
 
 
370 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.31 
 
 
361 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.38 
 
 
415 aa  148  2e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
369 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  32.17 
 
 
409 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.9 
 
 
349 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 
405 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 
405 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.21 
 
 
415 aa  136  6e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
369 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.93 
 
 
411 aa  135  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  32.45 
 
 
407 aa  135  1e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  32.48 
 
 
369 aa  135  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.43 
 
 
465 aa  132  1e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  31.07 
 
 
461 aa  131  2e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
461 aa  131  2e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.52 
 
 
408 aa  131  2e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
403 aa  131  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
401 aa  131  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.98 
 
 
406 aa  131  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.82 
 
 
401 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  31.31 
 
 
410 aa  129  7e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.86 
 
 
402 aa  128  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.96 
 
 
446 aa  128  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 
402 aa  128  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
402 aa  127  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 
403 aa  128  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  34.58 
 
 
359 aa  127  4e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.93 
 
 
453 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  29.25 
 
 
451 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.63 
 
 
414 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.21 
 
 
408 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.31 
 
 
414 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.69 
 
 
338 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.18 
 
 
501 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  29.75 
 
 
866 aa  122  1e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 
426 aa  122  1e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.77 
 
 
434 aa  121  2e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.38 
 
 
400 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.19 
 
 
417 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 
457 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  31.21 
 
 
408 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.29 
 
 
409 aa  118  2e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.52 
 
 
410 aa  118  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
412 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.09 
 
 
408 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>