More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4857 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  72.56 
 
 
452 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  100 
 
 
449 aa  902    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  65.91 
 
 
445 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  63.88 
 
 
445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  65.22 
 
 
451 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  63.23 
 
 
457 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  61.95 
 
 
452 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  60.8 
 
 
453 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  62.56 
 
 
458 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  60.71 
 
 
452 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  62.5 
 
 
454 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  62.53 
 
 
447 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  62.33 
 
 
458 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  62.56 
 
 
457 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  60.59 
 
 
439 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  58.5 
 
 
442 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  58.2 
 
 
450 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  57.88 
 
 
441 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  60.45 
 
 
457 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  56.92 
 
 
441 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  55.33 
 
 
454 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  56.24 
 
 
434 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.5 
 
 
456 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  55.53 
 
 
460 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  55.71 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  54.07 
 
 
455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.62 
 
 
457 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  53.2 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.03 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  52.97 
 
 
450 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  52.7 
 
 
450 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  51.48 
 
 
429 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  51.93 
 
 
448 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.09 
 
 
441 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  51.72 
 
 
449 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  53.18 
 
 
448 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  53.27 
 
 
444 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  52.05 
 
 
450 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  53.3 
 
 
442 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.66 
 
 
441 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  52.6 
 
 
457 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  52.6 
 
 
444 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  51.24 
 
 
449 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  51.9 
 
 
452 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.17 
 
 
441 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  49.89 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  48.4 
 
 
440 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.8 
 
 
445 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  50.45 
 
 
440 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.11 
 
 
448 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  49.66 
 
 
445 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  48.97 
 
 
443 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  50.9 
 
 
451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.57 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.89 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.35 
 
 
447 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  50.56 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  52.02 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.51 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  48.55 
 
 
453 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  50.45 
 
 
455 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  51.35 
 
 
461 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  49.32 
 
 
444 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  50.11 
 
 
458 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.85 
 
 
445 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  50.22 
 
 
451 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.67 
 
 
459 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  50 
 
 
474 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  49.78 
 
 
449 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  49.21 
 
 
447 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  49.19 
 
 
1121 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.18 
 
 
453 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  46.34 
 
 
492 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  49.89 
 
 
454 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.9 
 
 
440 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  44.8 
 
 
451 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  47.38 
 
 
454 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  45.33 
 
 
436 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.61 
 
 
439 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.33 
 
 
495 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  47.06 
 
 
450 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.33 
 
 
468 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  44.47 
 
 
449 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.11 
 
 
468 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.52 
 
 
444 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  47.02 
 
 
455 aa  359  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  46.68 
 
 
445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.68 
 
 
429 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  44.12 
 
 
451 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.72 
 
 
441 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.88 
 
 
448 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  45.95 
 
 
469 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.98 
 
 
445 aa  349  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.39 
 
 
448 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.1 
 
 
442 aa  346  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.05 
 
 
445 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  45.22 
 
 
467 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.66 
 
 
443 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  42.56 
 
 
431 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  42.56 
 
 
431 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>