More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4839 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  42.37 
 
 
269 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
274 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
273 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.2 
 
 
273 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 
269 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.98 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  36.96 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.13 
 
 
356 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.85 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  40.48 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  40.48 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  40.48 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  42.86 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.2 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 
624 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  37.3 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.07 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
409 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  43.52 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  42.34 
 
 
1039 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.99 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  38.17 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.53 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.18 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.46 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.46 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.73 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.46 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  40.38 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  38.93 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.59 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
1000 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  38.58 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.84 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  40.37 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  41.59 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  40.37 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.53 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  36.29 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  34.56 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  35.29 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.32 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  30.37 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  34.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  34.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  34.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.86 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.72 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.15 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.93 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  34.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
369 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.2 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  34.92 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  38.6 
 
 
418 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.14 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  36.75 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  38.39 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.05 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
379 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
280 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>