More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4831 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  100 
 
 		 527 aa  1073    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.94 
 
 		 532 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  52.99 
 
 		 531 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  51.92 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  50.88 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  51.78 
 
 		 534 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  51.3 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  51.57 
 
 		 524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  51.37 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.49 
 
 		 534 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.61 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  50.3 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  47.65 
 
 		 544 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  49.4 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  45.04 
 
 		 560 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  43.75 
 
 		 532 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  41.99 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  42.62 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 529 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  38.93 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  39.12 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  40.6 
 
 		 558 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  36.15 
 
 		 515 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  37.03 
 
 		 527 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 535 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 		 516 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  34.08 
 
 		 533 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 537 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  35.96 
 
 		 534 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  34.5 
 
 		 536 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  33.02 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 532 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  35.05 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 539 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 530 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  32.36 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 530 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  33.07 
 
 		 538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.94 
 
 		 538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 259 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 540 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.51 
 
 		 540 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.51 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 551 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 538 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.18 
 
 		 510 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.82 
 
 		 505 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.77 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.02 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 534 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.39 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 509 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 565 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 526 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.99 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.52 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.99 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.4 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.02 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.02 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>