More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4727 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  100 
 
 
198 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  80.42 
 
 
196 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  80.95 
 
 
197 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  75.13 
 
 
196 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  77.95 
 
 
203 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  73.02 
 
 
196 aa  258  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70.56 
 
 
198 aa  244  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.3 
 
 
201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.92 
 
 
201 aa  214  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.4 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.17 
 
 
203 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.8 
 
 
203 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  55.39 
 
 
214 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.5 
 
 
206 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  65.84 
 
 
201 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  64.55 
 
 
202 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  64.21 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  56.35 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  64.02 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  57.61 
 
 
203 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  53.76 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.76 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  52.15 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  49.22 
 
 
211 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  62.56 
 
 
197 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  54.79 
 
 
194 aa  174  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  55.73 
 
 
209 aa  174  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  65.75 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.59 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  65.61 
 
 
202 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  53.72 
 
 
200 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.82 
 
 
202 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  51.28 
 
 
212 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  51.27 
 
 
215 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  66.48 
 
 
200 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  47.55 
 
 
226 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.3 
 
 
197 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  38.83 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.91 
 
 
198 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  43.96 
 
 
224 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.5 
 
 
212 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  48.47 
 
 
203 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.49 
 
 
216 aa  141  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.12 
 
 
203 aa  141  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.52 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  46.46 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.67 
 
 
192 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.6 
 
 
202 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.33 
 
 
226 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.79 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  44.15 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.81 
 
 
206 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  43.52 
 
 
197 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  43.81 
 
 
211 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  43.62 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.68 
 
 
202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.55 
 
 
200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  40.78 
 
 
216 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.39 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  40 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  43.85 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  47.34 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  47.34 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  49.21 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  46.93 
 
 
192 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.37 
 
 
207 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.6 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.36 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.36 
 
 
212 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.39 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  44.09 
 
 
195 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  43.01 
 
 
198 aa  128  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 
212 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  39.89 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  40.82 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  42.27 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  44.33 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  45.03 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.33 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  40.43 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.1 
 
 
202 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.79 
 
 
203 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 
203 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3772  protein of unknown function DUF205  47.78 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  44.55 
 
 
213 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0425  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.6 
 
 
189 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.954266  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  41.94 
 
 
209 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  45.21 
 
 
192 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  43 
 
 
198 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.68 
 
 
203 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0391  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.02 
 
 
189 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>