174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4679 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4679  glutathione S-transferase  100 
 
 
328 aa  682  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0018476  normal  0.811499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4107  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.38 
 
 
326 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1455  glutathione S-transferase  73.62 
 
 
326 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3010  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.44 
 
 
347 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1431  Glutathione S-transferase domain  77.74 
 
 
336 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.858691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1656  glutathione S-transferase-like protein  72.31 
 
 
328 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0858873  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3749  putative glutathione S-transferase domain protein  68.1 
 
 
326 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3798  Glutathione transferase  68.1 
 
 
326 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1604  putative glutathione S-transferase  68.62 
 
 
328 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0421  Glutathione S-transferase domain protein  67.38 
 
 
329 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3241  hypothetical protein  69.55 
 
 
322 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0157  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.01 
 
 
328 aa  452  1e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2798  putative glutathione S-transferase protein  66.16 
 
 
328 aa  451  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.830078  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2382  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.15 
 
 
332 aa  451  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200845  hitchhiker  0.00582384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1509  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.14 
 
 
327 aa  448  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1579  IMP dehydrogenase/GMP reductase  66.56 
 
 
320 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.39795  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3062  Glutathione transferase  67.7 
 
 
336 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.795635  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1761  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  64.94 
 
 
330 aa  446  1e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0457126  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1060  glutathione S-transferase-like protein  66.97 
 
 
328 aa  446  1e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0432833  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1561  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.14 
 
 
327 aa  444  1e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.816774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1210  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.39 
 
 
323 aa  438  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4602  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.68 
 
 
328 aa  439  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2185  putative glutathione S-transferase  64.33 
 
 
329 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1723  putative glutathione S-transferase  62.58 
 
 
326 aa  434  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.959435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0169  putative glutathione S-transferase  63.22 
 
 
329 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0205783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2220  putative glutathione S-transferase  63.86 
 
 
333 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3400  hypothetical protein  62.35 
 
 
328 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2451  glutathione S-transferase-like protein  63.19 
 
 
328 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3343  glutathione S-transferase domain protein  61.28 
 
 
332 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1201  putative IMP dehydrogenase/GMP reductase  61.61 
 
 
323 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0853  putative glutathione S-transferase  63.3 
 
 
328 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4332  hypothetical protein  62.46 
 
 
328 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.164187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3494  glutathione S-transferase  62.04 
 
 
328 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2281  putative glutathione S-transferase  63.64 
 
 
330 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806368  normal  0.334105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3424  hypothetical protein  62.04 
 
 
328 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1469  hypothetical protein  61.35 
 
 
334 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3556  putative glutathione S-transferase  61.42 
 
 
328 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.997645  normal  0.49225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3421  hypothetical protein  61.42 
 
 
328 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3528  glutathione S-transferase  62.04 
 
 
328 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0794367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0543  putative glutathione S-transferase  61.3 
 
 
328 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0479  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.61 
 
 
328 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.342726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1116  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.3 
 
 
328 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.660957  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1137  glutathione S-transferase-like protein  62.15 
 
 
333 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2583  putative glutathione S-transferase  61.92 
 
 
324 aa  417  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378441  hitchhiker  4.39857e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0833  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.63 
 
 
325 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3520  Glutathione transferase  61.85 
 
 
328 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.374322  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0800  glutathione S-transferase family protein  59.94 
 
 
318 aa  414  1e-115  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.170497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3173  glutathione S-transferase  61.59 
 
 
332 aa  416  1e-115  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00834224  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3580  fructose-bisphosphate aldolase  61.89 
 
 
333 aa  416  1e-115  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0737  Glutathione transferase  60 
 
 
331 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.880673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01866  predicted glutathione S-transferase  60.43 
 
 
320 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.316571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3575  hypothetical protein  62.04 
 
 
328 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0519  Glutathione transferase  59.57 
 
 
331 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02971  predicted S-transferase  62.35 
 
 
328 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0599  conserved hypothetical protein  62.35 
 
 
328 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2598  hypothetical protein  61.59 
 
 
324 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3259  hypothetical protein  62.35 
 
 
328 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3290  hypothetical protein  62.35 
 
 
328 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02922  hypothetical protein  62.35 
 
 
328 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30350  hypothetical protein  60.67 
 
 
324 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0594  putative transferase  62.35 
 
 
328 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0374  hypothetical protein  64.6 
 
 
309 aa  405  1e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.520714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4417  hypothetical protein  62.04 
 
 
328 aa  405  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1276  glutathione S-transferase-like protein  62.11 
 
 
321 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.248613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3402  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.54 
 
 
318 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2206  glutathione S-transferase domain  65.44 
 
 
330 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3603  hypothetical protein  58.84 
 
 
319 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.383788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3394  Glutathione transferase  58.95 
 
 
326 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0270  glutathione S-transferase-like protein  59.2 
 
 
333 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.813177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2249  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.14 
 
 
329 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.386562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3495  putative glutathione S-transferase  58.07 
 
 
323 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0491711  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2507  hypothetical protein  57.85 
 
 
319 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2361  hypothetical protein  58.39 
 
 
319 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0702  putative glutathione S-transferase  60.86 
 
 
327 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0368  putative glutathione S-transferase  59.75 
 
 
326 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3998  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.62 
 
 
325 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721034  hitchhiker  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1835  glutathione S-transferase-like protein  58.15 
 
 
319 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000726325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2524  Glutathione S-transferase domain  63.91 
 
 
329 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0524835  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5405  Glutathione transferase  62.54 
 
 
314 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1591  glutathione S-transferase  61.35 
 
 
333 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0102059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0614  hypothetical protein  58.46 
 
 
315 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2323  Glutathione transferase  56.66 
 
 
338 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.131425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0242  glutathione S-transferase  60.74 
 
 
333 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1732  putative glutathione S-transferase  61.61 
 
 
324 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2137  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.31 
 
 
339 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.59074e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002964  predicted glutathione S-transferase  57.36 
 
 
315 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4275  glutathione S-transferase-like protein  55.1 
 
 
321 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584893  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2671  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.42 
 
 
337 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0021828  normal  0.0114712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02944  glutathione S-transferase  56 
 
 
314 aa  362  5e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0521  putative glutathione S-transferase  54.4 
 
 
327 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2004  putative glutathione S-transferase  52.45 
 
 
325 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2675  glutathione S-transferase  56.13 
 
 
316 aa  356  2e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1775  hypothetical protein  52.68 
 
 
327 aa  355  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2008  glutathione S-transferase-like protein  55.62 
 
 
319 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2276  glutathione S-transferase  56.07 
 
 
324 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4511  glutathione S-transferase-like  51.55 
 
 
320 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1173  putative glutathione S-transferase  51.42 
 
 
327 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1068  glutathione S-transferase-like protein  52.7 
 
 
322 aa  337  2e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.911478  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0652  glutathione S-transferase  51.84 
 
 
333 aa  330  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139367  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3852  putative glutathione S-transferase  53.85 
 
 
324 aa  328  5e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>