More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4623 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  79.82 
 
 		 228 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  79.65 
 
 		 228 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  79.37 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  78.32 
 
 		 230 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  77.38 
 
 		 234 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  77.09 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  76.92 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  77.33 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  74.89 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  77.63 
 
 		 234 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  74.89 
 
 		 239 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  74.22 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  76.89 
 
 		 232 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  74.55 
 
 		 233 aa  351  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  70.04 
 
 		 230 aa  343  8e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  70.22 
 
 		 227 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  69.33 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  69.82 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  53.81 
 
 		 389 aa  251  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.39 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.04 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  51.33 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  47.98 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  51.56 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  52.22 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  49.78 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  49.78 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  49.78 
 
 		 222 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  52.79 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  52.45 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  47.75 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  46.51 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  46.85 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  53.66 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  53.66 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  46.4 
 
 		 222 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  46.36 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  47.87 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  45.58 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  44.93 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  48.04 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  50.23 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  45.12 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  38.26 
 
 		 281 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.54 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.41 
 
 		 264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.77 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.33 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.33 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.9 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.08 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.47 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.41 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.59 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  35.48 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.44 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.75 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.51 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.52 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.8 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 191 aa  88.6  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.33 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  33.15 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  30.62 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>