More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4566 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  63.41 
 
 
285 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  61.87 
 
 
285 aa  358  8e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  52.52 
 
 
291 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  47.84 
 
 
288 aa  244  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  43.21 
 
 
287 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.5 
 
 
290 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  43.21 
 
 
287 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
281 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
280 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  42.14 
 
 
287 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
282 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  42.35 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.85 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  40.14 
 
 
282 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
240 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
281 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  42.07 
 
 
275 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
282 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
284 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  38.08 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
282 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  34.46 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  34.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  35.71 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  34.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  34.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  34.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  34.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  39.57 
 
 
284 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.36 
 
 
281 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 
275 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  36.26 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  41.49 
 
 
285 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  33.57 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  41.45 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
290 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  36.4 
 
 
283 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  34.89 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.73 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  36.15 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
275 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 
255 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.81 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.63 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  35.95 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.95 
 
 
362 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.07 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.39 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
526 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.8 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.78 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.78 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  34.65 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
581 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.76 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  35.81 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 
233 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  30.86 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.76 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.07 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  29.38 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.49 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.12 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.34 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.65 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  37.19 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  36 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  36 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  36 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  28.34 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>