More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4550 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  65.04 
 
 		 661 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.77 
 
 		 702 aa  758    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  64.88 
 
 		 661 aa  778    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 695 aa  1399    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.44 
 
 		 703 aa  762    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  79.83 
 
 		 688 aa  1063    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.44 
 
 		 703 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  61.53 
 
 		 654 aa  736    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  54.77 
 
 		 694 aa  652    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  77.83 
 
 		 697 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.3 
 
 		 681 aa  828    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  56.61 
 
 		 685 aa  701    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.26 
 
 		 705 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  58.97 
 
 		 643 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  70.76 
 
 		 641 aa  855    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  63.46 
 
 		 664 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  75.39 
 
 		 701 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  58.14 
 
 		 689 aa  719    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  53.9 
 
 		 711 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  77.64 
 
 		 688 aa  1053    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  78.14 
 
 		 697 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  77.41 
 
 		 683 aa  1067    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.89 
 
 		 701 aa  735    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  55.65 
 
 		 706 aa  705    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  58.45 
 
 		 681 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  64.32 
 
 		 664 aa  779    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  64.21 
 
 		 662 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  63.09 
 
 		 663 aa  763    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.2 
 
 		 666 aa  808    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  63.64 
 
 		 666 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.81 
 
 		 637 aa  680    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  63.32 
 
 		 666 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  55.12 
 
 		 703 aa  676    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.97 
 
 		 643 aa  782    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  58.36 
 
 		 683 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.56 
 
 		 646 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.73 
 
 		 642 aa  581  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  64.01 
 
 		 715 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  50.42 
 
 		 614 aa  575  1.0000000000000001e-162  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.68 
 
 		 650 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  63.6 
 
 		 720 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  70.41 
 
 		 704 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  63.6 
 
 		 720 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  49.68 
 
 		 686 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  49.51 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  51.61 
 
 		 657 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  50.83 
 
 		 657 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  47.96 
 
 		 621 aa  551  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  50.73 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.25 
 
 		 650 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  50.75 
 
 		 654 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.59 
 
 		 682 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  47.5 
 
 		 621 aa  547  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.17 
 
 		 666 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.75 
 
 		 660 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  49.92 
 
 		 695 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.57 
 
 		 675 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.82 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  49.84 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  50.25 
 
 		 669 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.19 
 
 		 675 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.91 
 
 		 671 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  47.36 
 
 		 682 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  48.7 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  47.78 
 
 		 695 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.61 
 
 		 678 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  48.17 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.42 
 
 		 673 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.96 
 
 		 652 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.92 
 
 		 676 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.69 
 
 		 678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.34 
 
 		 653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  47.37 
 
 		 684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.15 
 
 		 679 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.68 
 
 		 672 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  48.84 
 
 		 670 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.34 
 
 		 671 aa  512  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  48.47 
 
 		 684 aa  512  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 		 684 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  48.31 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.33 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.07 
 
 		 674 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.64 
 
 		 685 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  47.29 
 
 		 653 aa  505  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  47.29 
 
 		 653 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.95 
 
 		 642 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.57 
 
 		 667 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  47.92 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.12 
 
 		 656 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  47.2 
 
 		 713 aa  495  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  47.2 
 
 		 713 aa  492  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>