172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4523 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  58.44 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  56.68 
 
 
246 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  57.85 
 
 
241 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  56.45 
 
 
247 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  56.39 
 
 
258 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  50.4 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  51.15 
 
 
260 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  54.76 
 
 
251 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  47.97 
 
 
258 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  51.6 
 
 
257 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  50.79 
 
 
251 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  44.23 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  45.49 
 
 
251 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  43.15 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  40.4 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  37.9 
 
 
237 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  37.1 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  32.16 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  36.55 
 
 
240 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.97 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  34.91 
 
 
225 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  38.49 
 
 
274 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  34.76 
 
 
997 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.9 
 
 
452 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  39.44 
 
 
453 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  40.94 
 
 
242 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  41.8 
 
 
243 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  36.25 
 
 
248 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.89 
 
 
243 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  38.27 
 
 
245 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  41.2 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  38.59 
 
 
241 aa  99  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  41.27 
 
 
238 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  34.87 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  35.98 
 
 
447 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  40.68 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  30.17 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  37.02 
 
 
209 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  36.32 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  37.8 
 
 
449 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  38.08 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  34.53 
 
 
454 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  37.16 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  33.88 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.69 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  35.95 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.37 
 
 
570 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  34.72 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  31.51 
 
 
578 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.52 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  35.71 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  31.44 
 
 
562 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.48 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.2 
 
 
570 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  29.57 
 
 
559 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.94 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.55 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.62 
 
 
652 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  31.21 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  31.12 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  31.65 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  31.71 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  30.99 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  31.25 
 
 
692 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  31.51 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  31.96 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.5 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  35.75 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.48 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  35.24 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  30 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  29.8 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  28.83 
 
 
708 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  31.54 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  30.89 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  33.33 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  27.27 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.87 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  30.09 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  30.09 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  31.82 
 
 
703 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  29.6 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  29.58 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.6 
 
 
710 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.58 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  30.91 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  31.12 
 
 
278 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  33.78 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  32.31 
 
 
689 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  31.13 
 
 
703 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  29.46 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  30.36 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.78 
 
 
661 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  30.28 
 
 
670 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6718  hypothetical protein  37.28 
 
 
550 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  28.39 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  29.66 
 
 
693 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  31.91 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>