69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4444 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 225 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  39.75 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  40.53 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  42.45 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  37.61 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  40.97 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  42.79 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  42.41 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  32.22 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  31.28 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  32.74 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  31.96 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  31.53 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  31.07 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  26.84 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  21.97 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.14 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  28.99 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.58 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  25.79 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.79 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  27.95 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  35.8 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  28.11 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  21.83 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  32.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  33.14 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  31.14 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  36.9 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  27.07 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  21.51 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  28.21 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  27.07 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.54 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  22.13 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  25.64 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  31.6 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  26.38 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  28.45 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  29.74 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  28.42 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  34.54 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  26.43 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  35.35 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  23.67 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  22.84 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  25.44 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  26.22 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  29.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  20.88 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  20.88 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  36.19 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  28.12 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  28.21 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  25.54 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  30.56 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  24.65 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  29.26 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  26.44 
 
 		 228 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  29.48 
 
 		 231 aa  42  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  28.82 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>